增值税应纳税额是否正确，重点是当期销项税额和当期进项税额两个部分的审核，当期销项税额和进项税额的审核要点前面已作了介绍，这里重点阐述对增值税“应交税费”明细账和纳税申报表的审查。
1.增值税“应交税费”明细账审核要点
“应交税费--应交增值税”明细账，是为了全面核算和反映增值税的应缴、已缴情况而设置的。对纳税人“应交税费--应交增值税”明细账的审核，应主要注重以下几个方面：
(1)“应交税费--应交增值税”明细账中各项核算内容及财务处理方法，是否符合有关增值税会计处理的规定。
(2)增值税是否做到按月计算应纳税额，“月税月清”，有无将本月欠税用下期进项税额抵顶、滞纳税款的问题。
(3)有无多记“进项税额”，少记“销项税额”、“进项税额转出”，造成当期应缴税金不实的问题。
(4)生产销售的货物按简易办法计算缴纳增值税的企业，其不得抵扣进项税额计算是否正确;出口企业按出口货物离岸价与征、退税率之差计算的不予抵扣的税额是否在当期从“进项税额转出”科目转增产品销售成本等。
注册税务师应根据纳税人生产经营规模、会计核算水平以及增值税账簿设置等情况，选择相应的审核方法：
对于企业内部管理控制制度较完善，会计核算水平较高，账簿设置较规范的纳税人，一般采用审阅法、复核法、抽样检查法等审核方法。具体讲就是审阅检查“应交税费--应交增值税”明细账各栏目记录，将账簿记载的各项指标与会计报表、增值税纳税申报表的对应数据相核对，与增值税专用发票抵扣联相核对，检查有无差异。对调整账务、非正常业务账务、红字冲减账务应特别关注，调阅其记账凭证。同时抽样审核各类相关业务的账务处理，较迅速、全面地发现会计核算方面的问题。
对于会计核算不规范或企业内部管理控制制度不健全的纳税人，其增值税账簿记录往往不能作为审核的主要依据。应采用详查法，即审核每一笔经营业务情况，并可从销货发票、存货或银行存款等方面，审核其纳税情况。
2.增值税一般纳税人申报表审核要点
(1)本期销项税额。应根据“主营业务收入(出口销售收入)”、“其他业务收入”、“应交税费--应交增值税(销项税额)”等账户，检查内销货物和应税劳务的应税销售额和销项税额，出口货物的免税销售额。对于视同销售行为，应根据“在建工程”、“营业外支出”等账户核算内容，计算其销项税额。